NXD最适于存储以文档为中心的文件。这是由于NXD保留了文件、顺序、处理指令、注释、CDA-TA块以及实体引用等，而支持XML的数据库 XED(XML-enableddatabase)无法做到。XED是在原有数据库基础上扩展了XML支持模块，完成XML数据和数据库之间的格式转换和传输。从存储粒度上，可以把整个XML文档作为RDBMS表中一行，或把XML文档进行解析后，存储到相应的表格中。为了支持W3C的一些XML操作标准，Xpath、XED提供一些新的原语(如Oracle9iR2增加了一些数据包来操作XML数据等)，并优化了XML处理模块。
NXD一般采用层次数据存储模型，保持XML文档的树形结构，省掉了XML文档和传统数据库的数据转换过程。NXD还适用于存储“天然格式”为XML的文件，NXD还可以存储半结构化数据、在某种特定情形下提高存取速度以及存储没有DTD的文件(良构的文件)。
4.2、原生XML数据库的结构
原生XML数据库的结构可分为两大类：基于文本的和基于模型的。
基于文本的NXD(Text-BasedNativeXMLDatabases)将XML作为文本存储。它可以是文件系统中的文件、关系数据库中的BLOB或特定的文件格式。基于文本的NXD与层次结构的数据库很相似，当存取预先定义好层次的数据时，它比关系数据库更胜一筹。和层次结构的数据库一样，当以其它形式比如转置层次存取数据时，NXD也会碰到麻烦。这个问题的严重程度尚未可知，很多关系数据库都使用逻辑指针，使相同复杂度的查询以相同的速度完成。
基于模型的NXD(Model-BasedNativeXMLDatabases)是根据文件构造一个内部模型并存储这个模型。有些数据库将该模型存储于关系型和面向对象的数据库中，例如在关系型数据库中存储DOM时，就会有元素、属性、PCDATA、实体、实体引用等表格。其他数据库使用了专为这种模型优化了的存储格式。使用专用存储格式的基于模型的NXD假如以文件的存储顺序读取文件，其性能与基于文本的NXD相似。
4.3、原生XML数据库的特性
原生XML数据库的特性(FeaturesofNativeXML Databases)有：(1)文件集(Document Collections)，支持集合(Collection)的概念，其作用相当于关系数据库中的表和文件系统中的文件夹。(2)查询语言(Query Languages)，最常用的有XPath(对多个文件的查询作了扩充)和XQL，以及专有的查询语言。(3)更新和删除(Updates and Deletes)，NXD对文件的更新和删除方式从简单的替换或删除现有文件，到修改当前活动的DOM树，以及用于指定如何修改文件片断的语言。(4)事务、锁定和并发(Transactions，Locking，and Concurrency)，支持事务处理。锁定通常是对整个文档的，所以多用户并发性相对较低。问题的大小取决于应用程序以及“文件”的构成。(5)原生数据库提供给用程序接口API(Application Programming Interfaces，APIs)。(6)NXD的一个重要特性是它可以为XML文档提供“往返车票(round-trip)”。可以将XML文件存放在 NXD中，而且再取回“同样的”文件。对于以文档为中心的应用程序来说非常重要，因为CDATA部分、实体用法、注释和处理指令是这些文档不可缺少的组成部分。非凡是对于法律和医学文件，按规定这些文档必须要保持原样。(7)外部数据(Remote Data)，某些NXD可包含有外部数据，它来自存储在数据库中的文档。通常这些数据通过OD-BC、OLE DB或JDBC从关系数据中取出，模型可以是基于表格的或对象-关系型映射。(8)支持元素和属性的索引。
5、结论
XML技术的出现，使数据处理从文件方式到数据库系统再到文件方式的循环，但新的文件方式已经与最初的文件系统有了本质的区别----格式化文档。XML和关系数据库在数据应用和数据治理方面各有优势。
一方面，我们要研究数据库的新技术、探索数据库的发展方向；另一方面，在数据库的基本实现基础上，添加必要的新技术是探索新数据库的发展方向。
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